卵白質(zhì)是性命行為的中心分子，或許□準(zhǔn)確調(diào)控細(xì)胞內(nèi)龐大的性命歷程。良眾緊急的卵白質(zhì)（比方：共價(jià)妝點(diǎn)后的組▽卵白和轉(zhuǎn)錄因子等）通過(guò)與 基因組DNA彼此效率，調(diào)控了細(xì)胞的外觀遺傳形態(tài)，進(jìn)而影響基因的轉(zhuǎn)錄活性和外達(dá)形式。巨額咨詢外白，外觀遺傳○妝?點(diǎn)形態(tài)的變動(dòng)與○胚胎發(fā)育、癌癥以及其○他眾種疾病的爆發(fā)親近相干。因而，精準(zhǔn) 解析卵白質(zhì)-D NA的彼此效率看 =待深遠(yuǎn)剖釋 外觀遺傳妝點(diǎn)看待發(fā)育、癌癥以及其他疾■病的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制至▽合緊急。尊龍凱時(shí)人生就博

　　近年來(lái)跟著★○測(cè)序手藝 的繁榮，染色質(zhì)免▽疫共重淀測(cè)序手藝（★ChIP-seq）曾經(jīng)成為咨詢卵白質(zhì)-=DNA彼此效率的“金法式”。然而，古代△的C△ hIP○-seq手藝具 有良眾 局部 …性，征求須要巨額的肇端細(xì)胞、反復(fù)性較差、信噪比低、本錢上等題目。2015年，首個(gè)單細(xì)胞○ChIP -?seq手藝 =scDr■op- C○hIP 問(wèn)世，但scDrop-ChIP正在單個(gè)細(xì)胞中逮捕的組卵白妝點(diǎn)信號(hào)極端寥落，隨后，基于 Tn5轉(zhuǎn) 座酶的一系=列△單細(xì)胞測(cè)序手藝被開(kāi)荒出來(lái)，征求CoBATCH、尊龍凱時(shí)人生就博CUT&Tag、Paired-Tag、scCUT&Tag等。

　　即使這○些手藝正在單細(xì) 胞辨別率下摸 索染■色質(zhì)妝點(diǎn)方面的職能浮現(xiàn)卓異，但它 們都是基于二代測(cè)序（Nex★t-generat△ion▽ sequenci■n g， NGS）平臺(tái)。因?yàn)槎鷾y(cè)序的讀段較 短（平時(shí)為單端150bp， 雙端300bp），看待檢測(cè)基因組龐大區(qū)○域的染色質(zhì)妝點(diǎn)等外觀△基因組新聞 存正 ★在明明的局部性，特別是基因組中的反復(fù)序列區(qū)域（正在人類基因組中占52%無(wú)創(chuàng)優(yōu)+基因檢 測(cè)，約1。56 Gb；正在小鼠基因組中占45%無(wú)創(chuàng)優(yōu)+基因檢測(cè)，約1。2Gb）、“黑名單”區(qū)域 （正在○○人 類基□ ○ 因組中占 3。0%，約91 Mb（不征求著絲粒區(qū)域和 rDNA 區(qū)域）；正在小鼠基因組中占 7。0%，約191 Mb）以及基因組機(jī)合變異區(qū)域（如長(zhǎng)片 斷插入或缺 失無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前DN A檢測(cè)、串聯(lián)反復(fù)、染色 體易位和倒 位事 務(wù)爆發(fā)的 ▽區(qū)域 等）尊龍凱時(shí)無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測(cè)無(wú)創(chuàng)優(yōu)+基因檢測(cè)。這些□基因組龐大區(qū)域的可比對(duì)性 （M★appa bility，即測(cè)序數(shù)據(jù)與參考基因組比對(duì)的鑿鑿性和 獨(dú)一性）極端低，導(dǎo)致■短讀段測(cè)序數(shù)據(jù)難以鑿鑿定位到參○ 考基=因組中。目前，正在基○于 二 代測(cè)序平臺(tái)的數(shù)據(jù)… 闡述中，平時(shí)只可將反復(fù)序列的亞家族行動(dòng)一個(gè)團(tuán)體舉行闡述，一再無(wú) 法對(duì)△基因組中特定的單 個(gè)○拷貝的反復(fù)序列舉行…精準(zhǔn)闡 述。別的，看待基因組“黑名單”區(qū)域，因?yàn)檫@些區(qū)域正在△基 ○于二代短讀段測(cè)序平臺(tái) 的外觀遺 傳妝點(diǎn) 測(cè)○序數(shù)據(jù)中平=時(shí)顯示出十分 高的信號(hào)，而且與實(shí)習(xí) 樣本類型 和統(tǒng)治條目等無(wú)合，因而正在數(shù)據(jù)闡述時(shí)，咨詢職員平時(shí)△直接將其 驅(qū)除以裁減■引入的明顯噪音。這導(dǎo)致這些區(qū)域的外觀遺傳妝?■點(diǎn)形態(tài)目前已經(jīng)是未知的。因而，基于二代測(cè)序平臺(tái)來(lái)解析基因組=龐大區(qū)域的染色質(zhì)妝○點(diǎn)形態(tài)還是是一項(xiàng)…巨大離間。尊龍凱時(shí)人生就博

　　基于二代測(cè)序平臺(tái)檢測(cè)手段的另一個(gè)緊要局部正在于無(wú)法正在單細(xì)胞程度上直接檢測(cè)統(tǒng)一條DNA分子上相鄰調(diào) 控元件（比方相鄰的啟動(dòng)子和鞏固子）是否存正在相像組卵白妝點(diǎn)或相像轉(zhuǎn)錄因子的共占位事 務(wù)。別的，短讀段△=也束縛了其對(duì)染色質(zhì)妝點(diǎn)舉…行單倍型闡述的本 ○事，而單倍型=闡述看待探究二倍體細(xì)胞中等位基因上調(diào)控元件間的彼此效率及深遠(yuǎn)剖釋等位基因異質(zhì)性至合緊急。近年來(lái)，幾種基=于長(zhǎng)讀段的 外觀基因 組測(cè)序手藝被…開(kāi)荒 ■出來(lái)，征求Nanopore-DamI D和DiMelo-seq，它們有助于解析基因組龐大區(qū)域的卵白質(zhì)-DNA彼此效率無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測(cè)。然而，這些手藝無(wú)法實(shí)行單○細(xì) 胞辨?別率，還是局部于巨額肇□端細(xì)胞的樣…本，難以操 縱于咨詢細(xì) 胞群▽體內(nèi)部的○異質(zhì)性。

　　為了應(yīng)對(duì)這些離間，2024年10月7。